1、如果该宠物店的员工被刑事拘留，说明涉及刑事犯罪了（盗窃），那么是涉嫌犯罪的员工自己承担责任，跟公司无关； 2、如果公安机关侦查后认为不构成犯罪或者不予追究的，则恢复自由之身；当然，如果是公司的员工，不排除被追究刑事责任的可能，但是一般情况会判处缓刑，不影响工作； 3、至于损失，应该属于公司的商业秘密和财产，在司法机关查明事实的基础上，根据双方的过错承担相应的责任。
4、建议，先找公安机关了解案情，然后协商解决。毕竟对于该公司来说，可能损失不仅仅这些，还有商誉等无形资产的损失，特别是作为连锁店，还可能涉及到品牌的影响等等。如果协商解决不了，只能诉诸法律途径了。
夏卓优质答主实践中，常有小偷去商场、超市、宠物店等处行窃，在行窃过程中被保安或工作人员抓住控制后被民警带走的，在民警处理时，常常会因盗窃嫌疑人提出在被控制过程中有遭到打骂、强迫下跪等情况，并以此为由主张权利要求赔偿。
对于这种情形，保安和民警在处理时要注意以下三个方面:
1、明确职责，切实维护社会治安。保安人员作为治安辅助力量，在发现有违法犯罪嫌疑人时，在不采取限制人身自由强制措施的前提下，可以进行盘查，控制后及时报警，协助民警依法处理，切实发挥好群防群治作用，共同维护好社会治安。民警到达后，根据需要，可以对有现场作案嫌疑的嫌疑人经盘问后决定是否继续留置，依法履行管理职责。
2、规范行为，切实保护人身权益。在实际工作中，保安和民警应当严格执法、规范执法。保安在将犯罪嫌疑人控制，等待民警的过程中，不得有侮辱、殴打、虐待、强迫下跪等侮辱人格尊严、侵犯人身权利的行为。民警到达后，也应当按照法律规定，不能用威胁、引诱、欺骗、非法限制人身自由等非法方法获得口供。
3、明晰责任，理性通过合法途径维权。民警到达后，对确有证据证明有犯罪行为的，应当依法予以刑事处罚或行政处罚。对盗窃嫌疑人主张遭到殴打、辱骂、强迫下跪等侵犯人身权利的行为，应当注意收集证据，查清事实情况，对确实存在涉嫌犯罪行为的，应当移送有管辖权的单位立案侦查，切实维护公民的人身权益。
如经调查不存在侵犯人身权利的行为，也应当将调查情况向相关人员说明、解释，妥善处理。对未有违法犯罪事实和人身侵权事实行为的，当事人应当理性对待，通过正当途径维权，以免因采取偏激方式维权，反被处以治安处罚，就有些不太值了。
