哪种疫苗更好？
首先，两种疫苗都很好的，没有一种疫苗是最佳选择，也没有一种疫苗绝对最好。 这两种疫苗的差别主要在成分上，四价流感疫苗在三种灭活疫苗基础上又增加了两种病毒样颗粒（VLP）蛋白。 三联剂和四价疫苗都能刺激机体产生对抗流感病毒的抗体，都能有效预防流感；
而四价疫苗比三联剂多了两种VLP蛋白，因此相比三联剂来说，四价疫苗可能具有更好的保护效力。 但值得注意的是，目前的研究表明，接种三剂灭活流感疫苗后30天内，受种者血清IgG抗体阳转率可达98%以上，而接种四价流感病毒疫苗后，这一数值仅为76.4%；但两者预防感染的有效性（保护率）相近，均能达到接近100%的水平[2]。
这些差异来源于两种疫苗所含的组份有所不同，即四价疫苗多含有两种VLP蛋白，但目前的临床试验数据显示，这两种VLP蛋白并未提高疫苗的保护力。有研究人员猜测这可能是由于试验设计不同所致——给动物注射疫苗后，动物体内产生的抗体需要一段时间才能“积累”到足够的水平。而在这期间，如果动物接触到真正的病原体，身体会产生一定的免疫记忆，从而起到预防疾病的作用。也就是说，虽然注射了疫苗，但是身体可能会误以为病毒已经入侵，转而开始生成抗体以抵抗病毒的侵袭。所以，在注射疫苗后的一个月左右，抗体的检测会显示出阳性结果。 而如果抗体在注射疫苗的同时出现，那么测试就会呈现阴性。不过，这种抗体假阳性的结果并不会影响疫苗的保护作用。
也有研究者认为，可能是疫苗的制剂工艺影响了疫苗的保护效果。 目前，我国批准上市的流感疫苗有两种，一种是裂解疫苗，另一种是亚单位疫苗。其中，裂解疫苗是用基因工程的方法合成流感病毒表面的HA、NA两个蛋白的氨基酸序列，然后表达在这些微生物表面，再通过裂解法制备得到的；而亚单位疫苗则是用基因工程的方法直接合成流感病毒中的HA或者NA蛋白，通过纯化得到疫苗制剂。
有研究表明，使用裂解剂法制备的流感疫苗对人体的免疫反应与天然流感病毒相似；而亚单位疫苗虽然避免了裂解剂法有可能带来的病毒残屑等杂质的污染，但可能无法完全模拟自然病毒的感染过程，可能不会像裂解疫苗那样诱发强烈的免疫反应。
尽管两种疫苗都有较好的预防能力，但在具体的疫苗选择时，各机构及人员可根据实际情况选择疫苗品种。比如，对于患有哮喘、过敏性鼻炎或遗传过敏症的人群，因亚单位疫苗中含有的HA蛋白较少，就可能减少不良反应的发生。而对于那些不想每年都要接种疫苗的人，则建议选择可以刺激长期免疫记忆的裂解疫苗。